NetApp | Der positive Einfluss von Big Data auf Gesundheit und Wohlbefinden

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Der positive Einfluss von Big Data auf Gesundheit und Wohlbefinden

Der CIO von WuXi NextCODE erklärt, wie Daten die Genomanalyse beeinflussen:

22. Okt. 2018
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Übersicht:

  • Unternehmen und Forschungseinrichtungen können die Genomanalyse dafür einsetzen, die Gesundheit und das Wohlbefinden zu verbessern.
  • Dazu haben sie erstmals Zugriff auf eine Datenarchitektur, die auf die Nutzung von Genomdaten zugeschnitten ist.
  • Die Genomplattform wird der Standard für die Organisation, für Mining und die gemeinsame Nutzung von großen Sequenz-Datensätzen.

Dr. Hákon Guðbjartsson, CIO von WuXi NextCODE, weiß, was es heißt, ein Daten-Visionär zu sein. Mithilfe von Sequenzdaten hilft sein Team Genetikern, das volle Potenzial des Genoms zu entschlüsseln und damit die Gesundheit und das Wohlbefinden zu steigern.

WuXi NextCODE ist ein global agierendes Genom-Informationsunternehmen mit Niederlassungen in Cambridge, MA, Shanghai und Reykjavik. Das Unternehmen bietet eine globale Plattform für Big Data im Bereich der Genomanalyse. In den letzten 20 Jahren hat WuXi NextCODE eine der weltgrößten Datenbanken für Humangenom-Sequenzen zusammengetragen.

„Wir bei WuXi NextCODE nennen uns gerne das ‚Internet der DNA‘“, erzählt Dr. Guðbjartsson.

Die Genomforschung stellt die Datenverarbeitung vor eine gewaltige Herausforderung. Auch wenn alle Menschen die gleiche DNA-Struktur haben, ist die individuelle Gensequenz jedes einzelnen unverwechselbar. Wenn Sie Ihre eigene DNA mit der eines anderen Menschen vergleichen könnten, würden Sie ungefähr 5 Millionen Unterschiede feststellen.

„Aus einem Datensatz mit 5 Millionen Einträgen müssen wir genau die Unterschiede oder Mutationen isolieren können, die für die Behandlung von Patienten ausschlaggebend sind – die seltene Krankheiten hervorrufen, Krebs verursachen oder Ähnliches“, führt Dr. Guðbjartsson aus.

Herzstück der WuXi NextCODE-Plattform ist die relationale Gen-Datenbank, eine Datenarchitektur, die speziell dafür konzipiert ist, riesige Mengen von Genomdaten optimal zu nutzen.

NetApp® Cloud-Datenservices machen es möglich, Daten im laufenden Betrieb zu integrieren und damit effizienter zu rechnen als je zuvor.

„Für uns ist es ein wichtiger Benchmark, auf die Daten von 100.000 Individuen zur Analyse von Genomdaten zuzugreifen.“, erklärt Dr. Guðbjartsson. „Früher hatten wir regelmäßig Probleme mit Zeitüberschreitungen oder Dateifehlern. Aber als wir den NetApp Cloud Volumes Service getestet haben, waren die Berechnungen in weniger als einer Stunde abgeschlossen. Ein echter Durchbruch für uns.“

Heute bildet diese Architektur die Grundlage für bahnbrechende Genom-Forschungsprojekte auf vier Kontinenten. Sie etabliert sich als Standard für die Organisation, für Mining und die gemeinsame Nutzung von großen Sequenz-Datensätzen.

Weitere Informationen zum NetApp Cloud Volumes Service

WuXi NextCODE ist ein global agierendes Genom-Informationsunternehmen, das die Gesundheit von Menschen mithilfe von Sequenzdaten verbessert.

Dr. Hákon Guðbjartsson ist der Chief Information Officer von WuXi NextCODE. Er verfügt über mehr als 35 Jahre Erfahrung im Bereich der Softwareentwicklung. Bei deCODE genetics leitete er die Markteinführung des ersten webbasierten persönlichen Genom-Services deCODEme. Außerdem war er als Lead Architect und Entwickler verantwortlich für verschiedene Softwaresysteme, zum Beispiel für ein System zum Schutz der Patientenidentität und ein System zur Definition und Nachverfolgung von Patientenkollektiven.

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